Existe unha grande confusión entre ambos termos porque GNU/Linux (moitas veces referido como Linux) é o máximo expoñente do software libre, mais son cousas diferentes.

GNU/Linux é un sistema operativo libre. Linux, creado por Linus Torvalds; constitúe só o núcleo de sistema operativo, á parte do sistema que xestiona en baixo nivel os recursos de hardware proporcionando unha capa de abstracción para un acceso máis sinxelo e seguro desde os aplicativos ao hardware. O resto de compoñentes do sistema operativo (compilador, intérprete de comandos...) foron desenvolvidos polo proxecto GNU , polo que o seu promotor Richard M. Stallman defende o nome GNU/Linux para darlle crédito a ambos proxectos.

O software lbre é calquera software que garante as 4 liberdades definidas por Richard Stallman. Entre os que as cumpren atópase GNU/Linux, pero non é o único. Existen multitude de aplicativos libres. Algúns deles son: OpenOffice, e Firefo, Amsn, etc. Na sección de Ligazóns atópanse sitios web onde buscar estas e outras aplicacións.